Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc2bQ7TPM1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc2bQ7TPM1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms