Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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