Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb10Q6XAR7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms