Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms