Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ecm29Q6PDI5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ecm29Q6PDI5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ecm29Q6PDI5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ecm29Q6PDI5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ecm29Q6PDI5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ecm29Q6PDI5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ecm29Q6PDI5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm29Q6PDI5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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