Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms