Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slf2Q6P9P0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms