Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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