Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vsig8Q6P3A4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms