Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tpm4Q6IRU2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms