Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nop58Q6DFW4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms