Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q6DFW0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms