Protein–RNA interactions for Protein: Q692V3

Ttc41, Tetratricopeptide repeat protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 1,318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc41Q692V3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc41Q692V3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc41Q692V3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc41Q692V3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc41Q692V3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc41Q692V3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ttc41Q692V3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ttc41Q692V3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc41Q692V3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc41Q692V3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc41Q692V3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms