Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Pkp4Q68FH0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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