Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Trim24Q64127 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trim24Q64127 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trim24Q64127 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trim24Q64127 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trim24Q64127 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trim24Q64127 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trim24Q64127 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trim24Q64127 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trim24Q64127 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim24Q64127 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms