Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms