Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Lrrn1Q61809 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Lrrn1Q61809 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Lrrn1Q61809 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Lrrn1Q61809 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrrn1Q61809 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrrn1Q61809 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrrn1Q61809 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrrn1Q61809 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrrn1Q61809 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrrn1Q61809 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrrn1Q61809 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrn1Q61809 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrrn1Q61809 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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