Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms