Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms