Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms