Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HellsQ60848 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HellsQ60848 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HellsQ60848 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HellsQ60848 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms