Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms