Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWD5

Gm21943, Predicted gene, 21943, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21943Q5FWD5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21943Q5FWD5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms