Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lrrc43Q3V0L5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lrrc43Q3V0L5 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lrrc43Q3V0L5 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lrrc43Q3V0L5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms