Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp48Q3V0C5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp48Q3V0C5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp48Q3V0C5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp48Q3V0C5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp48Q3V0C5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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