Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms