Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms