Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms