Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 AV039307-201ENSMUST00000124795 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf166Q3U9F6 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf166Q3U9F6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms