Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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