Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms