Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms