Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ccndbp1Q3TVC7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ccndbp1Q3TVC7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms