Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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