Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trappc13Q3TIR1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trappc13Q3TIR1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trappc13Q3TIR1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trappc13Q3TIR1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trappc13Q3TIR1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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