Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms