Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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