Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem104Q3TB48 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms