Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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