Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cd300lgQ1ERP8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms