Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cers3Q1A3B0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms