Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms