Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpusd2Q149F1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpusd2Q149F1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpusd2Q149F1 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpusd2Q149F1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpusd2Q149F1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpusd2Q149F1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpusd2Q149F1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rpusd2Q149F1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rpusd2Q149F1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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