Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms