Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
StumQ0VBF8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms