Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms