Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxc4Q08624 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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