Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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