Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms