Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms